بھیرہ کی فوجی اور انتظامی اہمیت کی وجہ سے افغان بادشاہ شیر شاہ سوری نے 1540ء میں فصیل شہر کے باہر ایک عظیم الشان مسجد تعمیر کروائی۔ امپیریل گزٹ آف انڈیا (جلد دوم) صفحہ 386 میں مسجد کا ذکر اس طرح کیا گیا ہے کہ "نئے شہر کی بنیاد تقریباً 1540 عیسوی میں ایک عمدہ مسجد اور ایک مسلمان بزرگ کے مقبرے کے گرد رکھی گئی تھی"۔
سکھ راج کے دوران شیر شاہ سوری مسجد کو بری طرح نقصان پہنچا۔ 1859ء میں مشہور عالم قاضی احمد الدین بگوی نے اپنے طلباء اور مقامی آبادی کی مدد سے مسجد کی مرمت اور تزئین و آرائش کی۔ اللہ کی مدد سے اور علامہ کے مسلسل کام کی وجہ سے مقامی مسلم کمیونٹی نے مسجد کو اپنی مرکزی عبادت گاہ کے طور پر دوبارہ قائم کیا۔
فاؤنڈیشنز کے سروے میں بتایا گیا ہے کہ شیر شاہ سوری مسجد مضبوط بنیادوں پر ہے۔ مسجد کی دیواریں 18 سے 27 انچ موٹی ہیں۔ ان دیواروں کو مضبوط بنانے کے لیے چونا پتھر اور سرخ مٹی کے ساتھ لکڑی کے سہارے بائنڈنگ مواد کے طور پر استعمال کیے گئے۔ دیواروں میں 8 ½ انچ x 4 ½ انچ x 1 ½ انچ کے طول و عرض کے ساتھ خصوصی اینٹیں استعمال کی گئیں۔
تاریخ کے مطابق شیر شاہ سوری کے دور میں مسجد کا طول و عرض 127.6 x 69.9 فٹ تھا۔ آج مسجد اور زمین کی پیمائش 209 x 159 فٹ ہے۔ مسجد تین گنبدوں پر مشتمل ہے جس کا درمیانی گنبد سب سے بڑا ہے جس کا قطر 27 فٹ اور اونچائی 26 فٹ ہے۔ ارد گرد کے دو گنبد 14 فٹ اونچے ہیں جن کا قطر 20 فٹ ہے۔ صرف درمیانی گنبد کندہ ہے۔
مولانا عبدالعزیز بگوی نے 1902ء میں مینار تعمیر کروائے تھے۔ 1903ء میں احاطے میں اینٹیں ڈالی گئیں اور وضو کے لیے مرکز میں 12 فٹ گہرا تالاب بنایا گیا۔ مولانا محمد ذاکر بگوی نے 1912ء میں شمال میں دار الحدیث کے نام سے ایک بڑا ہال (24x59 فٹ) اور جنوب میں دارالقرآن کے نام سے ایک اور ہال تعمیر کیا۔ دارالعلوم عزیزیہ کے طلبہ کو یہاں دینی تعلیم دی جاتی تھی۔ مولانا ظہور احمد بگوی نے 1928ء میں تالاب کے دونوں کناروں پر بارہ دری تعمیر کروائی۔ 1939ء میں جناز گاہ بھی ایک قابل ذکر اضافہ تھا مولانا افتخار احمد بگوی نے میناروں پر کندہ کاری اور وضو کی جگہ اور لائبریری کی تعمیر کا کام کیا۔ تزئین و آرائش کا کام 1993 AD سے 1996 AD کے درمیان کیا گیا۔ احاطے کے اطراف، اندرونی، بیرونی دیواروں، گنبد، مینار، بارہ دری، چھت، اگر ٹائلیں بچھانے اور چاردیواری کی مرمت اور بحالی کا کام کیا گیا۔
تقریباً تمام بگوی علماء نے مسجد کی تعمیر اور تزئین و آرائش پر توجہ دی اور دستیاب وسائل کے مطابق تعاون کیا، محنت کی۔ اس سلسلے میں شہر اور گردونواح کے لوگوں نے ہمیشہ مدد کی پکار سنی اور اپنا حصہ ڈال کر عملی طور پر آگے آئے۔ یہ واقعی اللہ کی مدد ہے جس نے دہائیوں سے اس مسجد کی حفاظت کو ممکن بنایا ہے۔ اس سلسلے میں مولانا افتخار احمد بگوی نے اپنی تقریر میں بھیرہ کے لوگوں کے لیے درج ذیل الفاظ کہے ’’بھیرہ کے لوگو! آپ کی پہچان اس قدیم مرکز علم کی وجہ سے ہے۔ یہ شہر اپنی تاریخ کی وجہ سے معزز ہے جو اس مسجد کے ہر سنگ بنیاد کے ساتھ دفن ہے۔
